除磷剂主要针对污水中的正磷进行强化絮凝处理。多投加于生化池后，用于处理经微生物将水中的偏磷、有机磷转化后的正磷，两者共同除磷，可彻底处理磷污染，达标排放，大大的降低了处理成本及污泥产量。
在好氧池出口，二沉池前投加除磷剂，投加后进入二沉池中进行反应是常用的。这种投加方法要比直接投加于初沉池中效果更好，产泥量更少，不会对微生物处理产生影响。